347 ҷузъи кимиёвии пӯлоди пӯшида, муайян кардани интерферон-ҷавобгӯи инсон, ки интеригенҳои лейкоид-вобаста антиген-а (HLA-a) Charerone Experrometrometry-и пайвандро (CLMS) истифода мебаранд

Ташаккур ба шумо барои боздид аз Nature.com.Шумо версияи браузерро бо дастгирии маҳдуди CSS истифода мебаред.Барои таҷрибаи беҳтарин, мо тавсия медиҳем, ки шумо браузери навшударо истифода баред (ё Ҳолати мутобиқатро дар Internet Explorer хомӯш кунед).Илова бар ин, барои таъмини дастгирии доимӣ, мо сайтро бе услубҳо ва JavaScript нишон медиҳем.
Слайдерҳо се мақоларо дар як слайд нишон медиҳанд.Барои гузаштан дар слайдҳо тугмаҳои қафо ва ояндаро истифода баред ё тугмаҳои контролери слайдро дар охири ҳар як слайд ҳаракат кунед.

Тавсифи Маҳсулот

Пӯлоди зангногир 347L Coil Tubes, Синфи пӯлоди: SS347L

Системаи сигнали интерферон вокуниши қавии пайвандакҳоро ба доираи васеи сигналҳои патогенӣ ва дохилӣ аз муҳит амалӣ менамояд, ки дар натиҷа зергурӯҳҳои сафедаҳои ғайримуқаррарӣ.Мо Spectrometry DSS-Edvertry-ро истифода бурдем (CLMS-и додашуда (CLMS) барои ошкор кардани ҳамкориҳои нави сафеда ва сафеда дар доменҳои сафедаҳои интерферон.Илова ба протезаҳои боздошти байниндаркази интерфарматҳо ва ғайримуқаррарии байнисоҳавии протерентҳои байниҳамдигарии интерферон-ғайримуқаррарӣ, ба монанди MX1, USP18, OAS3 ва OAS3 ва Stat3.Мо ба тасдиқи orttogonal, ки маҷмӯи навтарин шабакаҳои протерен-протехнинро, ки аз ҷониби HLA-HLAPERS (H2bfs-HLA-A-A-HMGA1 ташаккул дода шудааст ва таҳсили минбаъдаи онҳо бо истифодаи моделсозии динамикаи молекулавӣ.Моделсозии динамикаи мутобиқии маҷмӯи сафеда якчанд сайтҳои амалкаро ошкор кард, ки ҳамкориҳои дар НОМИН-ро инъикосёфта муайян карданд.Дар якҷоягӣ, мо як омӯзиши озмоишии интерферонро пешниҳод менамоем, ки интерферонро муайян кунад ва барои васеъ кардани динамикаи нави муштарак дар микроевҳои сафеда пешниҳод кунем.
Пеш аз оғози вокуниши мутобиқшавии мутобиқшавӣ, системаи мудофиаи мизбон вокуниши antimicroobial, ки оилаи пинҳонии алоҳидаи алифбои алифбои алифбои алифбои алифбои алоҳидае, ки интеронон меноманд (IFNS).Навъи IFNS IFENS IFNSES IFNTES ва IFNACE Ҷавобҳои мобилӣ, аз ҷумла антивирирал, ProPOPOPTOTICOUTUTICOUTAITARTIATIATIATIATIATAITARTIATURSUTICTIACTIATAITERAITESS ..Дар одамон, 13 зербахши IFNOT маълум аст, ҳама дар хромосома 91 навишта шудаанд. Тааҷҷубовар аст, ки танҳо барои истифодаи клиникӣ омӯхта шудааст.Ба наздикӣ таваҷҷӯҳи махсус ба тадқиқот дар бораи зеризаминии зерхоғазии дигар, эътибори махсус дода шуд.Тадқиқоти охирин нишон дод, ки IFNα14 яке аз онҳост ISOFMALS мебошад, ки дар маҳдудияти HBV2 ва ВИЧ-13,4 дар муқоиса бо Centryptpe Cenonical Subtype аст.
Таъкид гардид, ки ман ба навъи қабулшудаи интерферетерҳо (IFNER1 ва IFNAR2) Cascade сигнал (IFNADDED ва IFCARDED TOREUSTUDE TINFED TYKUS Kinases Tyk2 ва Jak15,6 миёнаравӣ) миёнаравӣ кард.Ин Ҷанус Кинасс Киназорҳо транскрегати сигнали сигналат ва протекторҳои протексияи протексия (Мақола (Матафо 1 ва Стюпс2) дар бораи пасандозҳои зиреҳнашуда барои ташаббуси гетеродиммайдизатсияи дукаратаи домени SH2.Дар натиҷа, IRF9 гетеродимони МТФТ-ро банд мекунад, ки маҷмӯи омилии омилии IFN-и ҳавасмандшуда 3 генро ташкил медиҳад ва транспексияи байниҳамдигариро дар соли 2000 ташкил медиҳад (ISGS) 5,6,7,8.
ISGS қитъаи системаи иммунии вироишро ташкил медиҳанд, алалхусус дар посух ба ҳамлаи вирусӣ.Ҳамчун хати аввали дифоъ аз сирояти вирусӣ, ҳуҷайраҳо зуд ҳамкориҳои васеъи сафеда бо протагинҳои мобилӣ бо доираи васеи чорабиниҳои биологӣ паҳн мешаванд.Ин прототҳо ретсепторҳои шинохтаи намунаҳо, молекулаҳо, омилҳои нархгузориро дар бар мегиранд ва протезаҳои нархгузорон ва сафедаҳо бо функсияҳои антидириралӣ, инчунин танзимгарони манфии вокунишҳои импошон.Бисёре аз маълумот дар бораи фаъолияти ISG аз экрани фунтсионалӣ бо истифода аз скринҳои функсионалӣ10,11 ё усулҳои асал (Сира, Ройӣ ва ҳамдардӣ) мебошанд, ки дар онҳо ISGS-и инфиродӣ изҳор карда мешаванд ё аз рӯи вирусҳои гуногун санҷида мешаванд.Гарчанде ки ин таҳқиқотҳо хосиятҳои антивираҷирии ISGS-и ISG-ҳои инфиродиро муайян кардаанд, механизмҳои аслии ҳар як Исгҳо асосан номаълум боқӣ мемонанд.Умуман эътироф карда мешавад, ки бисёр протетҳо бо як ё якчанд вобастаҳо барои таъмини фаъолияти пурра муошират мекунанд, аз ин рӯ ISGS муошират бевосита ё ҳамкориҳои онҳо аз ҷониби сафедаҳои мобилӣ миёнаравӣ карда мешаванд.Масалан, таҳқиқоти протсомосҳои фотосипи ATCPASTIONTION VCP / P97 ҳамчун як шарафи асосии ITITM3 муайян карда шудааст, ки камбудиҳо дар навъбанди Луғосомалҳо оварда шудаанд, гардан ва қотилжаи зарраҳои вирусиро муайян мекунанд.Истифодаи эммейнипитсионӣ, мо VAPA, протеини ВАТАЛ, алоқамандро ҳамчун шарики муштарак бо камолоти виринии Вирестрин, ки холестиринобро бо истифода аз системаи ду-гибридӣ муайян кардааст, муайян намудем.Дастгирии илмӣ 15, 16.
Раванди бунёдии биологӣ, ки дар қатъ гардидани сироят ва тағйири ашаддӣ ширкат варзидаанд, ки бо як молекулятсияи асосии бисткуризатсия (MHC) миёнаравие мебошад.Пепросс (8-12 то кислотаҳои тоҷикӣ) аз clatched, пешакии пӯлод ё гумроҳкардашуда (иборат аз MHC-ман аз MHC-ман занҷирҳои вазнин ва рӯшноӣ, ки β2 млоглобулин номида мешавад; β2m) 17,18.Дар натиҷа дастовардҳои мӯътадили МТК ба сатҳи ҳуҷайра интиқол дода мешаванд, ки дар он ҷо онҳо пепозҳои дохили каҷро ба CD8 + T убур мекунанд (ҳуҷайраҳои Cytotoxic) 17.Ҳуҷайраҳо ин патогенҳо ва чашмакҳои википедҳои махсуси селексияро иҷро мекунанд ва нест мекунанд.Аз ин рӯ, микроорҳо ва ячейкаи варамҳо аксар вақт раванди пешниҳодкунандаро пешгирӣ мекунанд, то назорати иммунии иммуниро пешгирӣ кунанд.Ғайр аз он, MHC-Ман дар 40-90% омосҳои инсонӣ нишастааст ва аксар вақт бо пешгӯиҳои камбизоат бо пешгӯиҳои камбизоатӣ алоқаманд аст.
Газоҳое, ки дар вокуниш ба вокуниш ба вокуниш ба вокуниш ба вокунишҳо иштирок мекунанд, бояд ба зудӣ дар бораи ҳолати истироҳат ва ҳолати транскрипсияи фаъол зуд гузаранд.Аз ин рӯ, якчанд прототҳои камулулавӣ дар ҷавоб ба посух ба посухи миёна дар муддати кӯтоҳ, аз ҷумла азнавсозӣ ва тағир додани таблиғот 20,21 ҷалб карда мешаванд.Аксари таҳқиқотҳо ба муайян кардани шарикони инфиродӣ Протеин дар ҳузури IFN нигаронида шудаанд.Якчанд таҳқиқоти протомикӣ ва транскриптикӣ дар системаҳои ячейкаи намунавии намунаи намунавии намунаи IMPER таъсири КИТ-ро аз манзараи мобилӣ дур карданд.Аммо, сарфи назар аз фаҳмиши парвариши динамика аз ҷониби интерфронси интерфонсионӣ мо то ҳол дар бораи иштироки ISGS каме мешиносем.Ҳангоми баррасии мураккабӣ ва динамикаи пайдарпайи интерферон, ду савол ба миён меоянд: (i) Оё имкон дорад, ки маҷмӯаҳои бисёрвақтиро, ки дар сигналҳои фаврӣ иштирок мекунанд ва (ii) ба даст меоранд ва () ин муштарак ба фазои 3D муроҷиат карда мешавад?
Барои ҳалли ин масъалаҳо, мо disccoinimide subleatide suberation-mincialder-minfertient-minferment-molder-massive (DSS) бо оммавии шабакаи оммавӣ (CLMS) барои омӯзиши шабакаи байниҳамдигарӣ ва динамикаи он.DSS вомбаргҳои ковалентро байни боқимондаҳои конвейтсерҳои проксионӣ ва / ё мураббаъ протеин дар Vivo илова мекунанд.Таҳлили MS сайтҳои мушаххаси romslenciniting нишон медиҳанд, ки наздикии фазоитии минтақаҳоро дар як сафедаи мушаххас, робитаҳои дохилӣ ё навсозиҳо дар маҷмӯаҳои сафеда номбар мекунанд.Бо истифода аз ин равиш мо якчанд маҷмӯаҳои равӣ протеинин ва инчунин шабакаҳои байниҳамдигарии бисёрсафҳаро баррасӣ кардем.Бо роҳи санҷиши минбаъдаи як зербасти ин муоширати нав, мо нишон медиҳем, ки H2BFS (H2B MEST; Маъюблер ҳамчун H2B-ро ҳамчун шарики ҳатмӣ барои HLA-а номида мешавад.
Ҳуҷайраҳои FLO-1 яке аз беҳтаринҳоянд, ки дар моделҳои vitro-и orenocarcinom-orenocarcinom-orenocarcinoma orenocarcinoma indic мебошанд, зеро онҳо хусусиятҳои асосии номутаносибии talors22,23-ро тақозо мекунанд.Аммо, на ҳама варамҳо иммунгаранд ва муайян мекунанд, ки оё ҳуҷайраҳои FLO-1 ба табобати интерферерҳо посух медиҳанд, мо бо чашмакҳои FLO 1 NG / ML барои 72 соат табобат кардем.Ҳуҷайраҳои FLO-1 инҷояи барвақти PSTAT1 ва IRF1 нишон доданд ва 7 соат пас аз табобат идома дода, бо коҳиши сатҳи дақиқи IRF1. (Тасвири 1A).ISGS (MX1, ISITM1, OAS1 / 2 ва ISG15), ки пас аз 6 соат бозии марҳилаи классикиро ба вуҷуд овардааст (Тасвири 1а).Якҷоя, ин маълумотҳо нишон медиҳанд, ки ин модели мобилиро барои омӯзиши аксулҳои интерферон истифода бурдан мумкин аст.
Аксуламалҳои гуногуни сафедкунандаи сафеда дар ҳуҷайраҳои FLO-1 пас аз табобат.(A) ифодаи сафеда дар ҳуҷайраҳои FLO 1 бо 10, 6, 24, 48 соатҳои имтиёзнок бо истифода аз анибодияҳои зикршуда таҳлил карда шуданд.Б) bluomassie blue blub blute Black Statts Stattacts Standcactions пас аз пайвастшавӣ бо DSS бо DSS барои замонҳои зикршуда ва консентратсияҳо.(В) Намояндаи Imovoblot бо P53 (DO-1) аз худи ҳамон намунаҳо санҷида шуд, то дараҷаи пайвасти сафеда протоколии сафеда арзёбӣ кунад.
Барои гирифтани ландшафтҳои муваққатии протеини протеини протеин, мо DSS-ро истифода мебурдем, аз сабаби ҳарчи ҳарчи зудтари истиқоматӣ ва вақти воатӣ аз сатҳи тағйирёбанда ба таври васеъ истифода бурда мешавад.Вақти бозгашти кӯтоҳ ба пешгирии ташаккули агрегатҳои калони протинаҳои кандашуда кӯмак мекунад, ба ин васила устувории кросслинкерро нигоҳ медорад.Барои муайян кардани тамаркузи оптималии DSS-и оптималӣ ва аз ҳад гузашта мо чашмакҳоро ба 5, 2,5 ва 1 мм ва 1 мм ва 1 мм, мутаносибан 5, 5 маротиба, ва 30 дақиқа аз ҷониби SDS-саҳифа ва таҳлили lysates-ро таҳлил кардем (Маълумот нишон дода нашудааст).Лависаҳои ҳуҷайра ба назар мерасанд, ки дар камтарин консентратсияи пасттарин ва дар нуқтаи кӯтоҳтарин ҷой доранд.Аз ин рӯ, DSS ба 1, 0,5,5 ва 0,1 мм зиёда аз 5 дақиқа (расми 1B) буданд.Рақзаи оптималӣ барои 5 дақиқа бо 0,5 мм DSS барои 5 дақиқа мушоҳида карда шуд ва ин шароит барои ҳуҷайраҳои бо IFTα интихоб шудааст.Илова бар ин, ба рақами 1C блоки ғарбиро бо истифодаи P53 (DO-1) барои арзёбии дараҷаи пайвасти сафеда иҷро мекунад.
Ҳуҷайраҳои FLO-1 бо 10 NG / ML барои 24 соат пеш аз илова кардани Croslowlinker табобат карда шуданд.Баъдтар ҳуҷайраҳои пайвастшуда бо протеолизҳои ду қадам ва сафедаҳо аз ҷониби фаҳмо коркард карда шуданд (Расми 2) 24,25.Потоколҳои салибмардашуда аз ҷониби массажравии оммавӣ таҳлил карда шуданд (расми 2).Сипас Spectrra MS / MS ба пайдарҳамии сафеда мувофиқат мекунанд ва бо MAXQUENT26,27 ҳисоб карда мешавад.Потоколҳои салиб-XL-ро аз тамошои барномаи ба дастовардашуда бо истифода аз намоиши SIM-XL ва пайвастагиҳои инфиродӣ бо истифодаи манбаи комплексии манбаи кушодашавии нармафзор (расми 2) муттаҳид карда шуданд (Расми 2).SIM-XL ҳамкориҳои сафеда, жопайнҳо, занҷирҳои сафеда ва занҷирҳои инфиродӣ дар Medeals оддӣ ё мураккаби протеини оддӣ ё мураккаби протеини оддӣ муайян мекунад ва скриптҳо барои зинапоя дар сохторҳои сафеда оварда шудаанд.Ғайр аз он, он ҳар як салоҳиятро ҳамчун ҳисоби ID тибқи сифати SP / MS29 дар спектралии MS / MS29 ишора мекунад.Якчанд ҳамкориҳо ва комплексҳои баланди сафеда муайян карда шуданд ва истифодаи нави муштарак бо истифодаи ҳаммуайянкунии муштарак ва тағиротҳои мутобиқии маҷмӯӣ бо истифода аз динамикаи молекулавӣ (расми 2) 30, 31.
Шарҳи Scemication оид ба усули гилхом.Ҳуҷайраҳои FLO-1 бо 10 NG / ML барои 24 соат табобат карда шуданд, ки пас аз 24 соат бо истифода аз DSS Production Crossin Crosenting бо истифода аз DSS Productions Production-ро истифода бурд.Истифодаи намунаҳои пайвастшуда бо истифодаи массаи хислатҳои ордрабрафҳо ва минбаъд барои тақсим кардани прекурсорҳои пепситҳо дар вақти LC-MS / MS таҳия карда шуданд.Ду пепсидорҳои пайвастшуда аз ҳисоби ба даст овардани мошини ба дастовардашуда аз ҳисоби сабти спектаклҳои прокр (SIM-XL) муайян карда шуданд ва ҳама пайвастагиҳо бо истифодаи қубурҳои ҳисоббарорӣ ба шабакаи мураккаб муттаҳид карда шуданд.Дар асоси холҳои бардурӯғи бардурӯғи баландии сатҳи эътимоди нодуруст.Истифодаи мутақобилаҳои нави протеин бо истифода аз протеин бо истифода аз ҳаммаблағгузорӣ ва тағиротҳои мутобиқшавӣ дар маҷмӯаҳо (MD) моделсозии молекулятсия баррасӣ карда шуданд.
Ҳамагӣ ~ 30,500 ва ~ 2800 пептинг бо истифода аз MAXQUET Муайян карда шуд ва мушаххасоти IFNSTIONTIONS (Мизи иловагӣ S1, 2) ошкор карда шуд.Тақсимоти дарозии пептак дар ҳарду ҳолат таносуби баландтари пептарзҳои калонтар нишон дода, мавҷудияти потепсияҳои пайвастшударо (расми 3б, C) нишон дод.Ғайр аз он, таносуби калонтари пептилияҳои калонтар дар 40-55 дар намунаҳои табобати SEFT-SOUND мавҷуд буданд (расми 3C).Харитаи сафеда нишон дод, ки сафедаҳои сабти байниҳамдигарӣ ба намунаҳои ғайримуқаррарӣ, аз ҷумла MX1, IFET1 / 3, OAS2 / 3, DDX58 ва HLA-F (Расми 3D).Таҳлили роҳҳо барои сафедаҳо беш аз се маротиба бо истифода аз базаи REACTION-ро бо истифода аз маркази реактивии IFC, ки намоиш дода мешавад, нишон дода шудааст, ки пешниҳод ва коркарди антитофини масхарабоз ва коркарди роҳи бартаридошта (расми 3E) буд.Мувофиқи ҳисоботи қаблӣ, посухҳои антивиририрӣ, ки аз ҷониби OAS ва ISG15 MITION MAILESION MAILESIONS MESEL15 МО НИГОҲ ДОРЕД.Ғайр аз он, пайвандҳои ҷуброни мушаххаси сафеда аз ибтидо аз ҷониби MS / MS Spectra бо истифода аз SIM-XL истифода шуданд.Таҳқиқоти ахир гузориш доданд, ки 104 ISGS 20 вирусро аз 9 вирус аз ҷониби метри-таҳлили тадқиқоти инфиродӣ аз рӯи 5 навъи ҳуҷайра аз ҷониби метри-таҳлили инфиродӣ истифода мебаранд.Бо вуҷуди ин, ба рафъи маҳдудиятҳои ҳисоббаробаркунии тсилҳизонидани маҷмӯа, мо бо маълумотҳои хурдтар барои омӯхтани ҳамкориҳои имконпазири финдӣ байни рӯйхати ҷиноятҳои IRDDS хабар додем ва аксарашон ISS мебошанд.
Дар посух ба IFNET IFENSS-и дилхоҳ баёншуда ифтитоҳ намоед (маълумоте, ки аз MAXQUET гирифта шудааст).(A) Диаграммаи Venn - ифтитоҳи шумораи пептингҳои умумӣ ва истисноии дар IFNSET14 муайяншуда, ки дар IFREST14-ро табобат карда, намунаҳои табобатшударо муайян кардааст.Тақсимоти дарозии пепситаъсайравии androted (B) ва IFNα-ҳои (в) намунаҳои кирдор.(D) Харитаи гармӣ намояндаи log2 (шиддатнокии LFQ) дар байни табобатнашаванда ва IFRα14 бо ҳуҷайраҳои FLO 1-и FLO.Панели чап протецинро дар ҳузури IFTNα-и фаъолона фаъол менамояд.(Д) гистограмма нишон медиҳад, ки пас аз табобат кардани IFNTAPTINGIOWи бузурги ғанкахши бузург.Дохилшавии базаи реактивӣ зиёда аз дигаргуниҳои чорпошударо дар сафедаҳои возеҳи uperive таҳлил кард.
Ҳавасмандкунии байниҳамдигарӣ-миёна ISG хуб аст, аммо дар сатҳи молекулавӣ он қадар фаҳмида мешавад, ки ин протезаҳо дар доираи васеи функсияҳои биологӣ чӣ гунаандМо ҳамкориҳои протеинро бо дараҷаи баланди эътимод байни ISGs таҳқиқ мекунем.Ҷолибе, ки мо шабакаро аз ҷумла MX1, USP18, USP18, USP1, OAS3, USP1, USP1, USP1, USP1, OST1, ки дар посух ба табобати IFNCT-ро ташкил медиҳанд (Тасвири 4, Ҷадвали S2) 32,33,34.Муҳимтар аз ҳама, ин амалҳои муштараке, ки дар ҳама сегонаҳо бо IFFα буданд ва дар намунаҳои беасос пайдо нашуданд, пешниҳод карданд, ки онҳо махсусан дар посух ба табобати IFNCT ташкил карда шудаанд.Маълум аст, ки Ҳисобот11 ба таври интиқолӣ ба таври интиқолӣ баён кардани ин iSGs-ро танзим мекунад, аммо ҳамкориҳои он бо ISGS дар сатҳи сафедаҳо омӯхта нашудааст.Сохтори кристаллии Статика1 нишон дод, ки домени чархиаш (CCD) ба ҳамкорӣ бо ДНК ва протомон ҳангоми ташаккули ДИВАР15 шомил намешавад.Ин α-Хомӯшӣ сохтори чархи helices эҷод мекунад, ки барои амалиётҳои байниҳамдигарии гидрофилии сатҳи гидрофилии сатҳи гидрофилиниро таъмин мекунад.Дар маълумоти кории мо, мо мушоҳида кардем, ки аксари байниҳамдигарии СТТМ дар домени SETEX, ки дар домени SC2 қабл аз CC2 пеш аз ccd, думи C-Spacinal (пасандозии 700-708) рух додааст (Тасвири 400-708).Тадқиқоти қаблӣ гузориш дод, ки ба домени CCD ва DNA-и ҳатмӣ (DBD) -и DBD (DBD) -и DBD (DBD) -и INSENTAND-и INSERSED IDFERACTED ба кор бурда шавад, то ки ҷилавгирӣ кардани намуди интерферон ҳастам. 24.Маълумоти мо инчунин нишон доданд, ки домени каталитикии USP18 бо Store1 DBD-и UST1 (Тасвири 48) амал мекунад (Расми 4а, г), пешниҳод мекунад, ки ҳарду статсионарӣ ва Стеарк 4 метавонанд дар ҷалби USP18 ба ISNAR2 нақши бозӣ кунанд.
Шабакаи сафеда-протеин дар ҳуҷайраҳои пайвастшуда муайян карда шудааст, ки агар ҷудо шавад.(A) Қитъаи муштараки муштараки ҳамкориҳои сафеда ва сафеда дар барномаи SIM-XL сохта шудааст), бо хатҳои муоширати байниҳамдигарии байниминкулкӯҳӣ (маҷмӯи classlink that 3.5).Доменҳои шахсияти гуногун бо рангҳои онҳо қайд карда шудаанд.Доменҳои OAS3: OAS1_C (160-344), OAS1_C (559-745), NTP_CERSSF_2 (780-872) ва OAS1_C (903-108).Доменей Робо1, IG_3 (67-151), I-Max (260-357), IG_34 (35-347), IG_3 (354-529), FN3 (562-546), FN3 (678-758) ва FN3 (777-864).Майдонҳои Stat1: Статси (2-120), Stat_alpha (143-309), Stat_alpha (32-409), SP2 (573-457), Ш.Д.(Б) тамошобингари даврии сафедаҳои пайвандшуда (MX1, UBP18, OAS3, робе, робо, робо, мутаносибан бо истифода ва сурх нишондодашуда нишон дода шудааст.Ҳадди истинод дар 3.5 муқаррар карда шуд.Қитъаҳои DOT сайтҳои ҳамкориҳои статистикаро бо MX1 (C), USP18 (D), Робо1 (E) ва OAS3 (F), инчунин ҷойҳои муштараки K ё SPESS дар байни ду пепулҳо нишон медиҳанд.Дар расм, ҳадди аққали ҳисоби салиб ба 3.0 муқаррар карда шудааст.G) Скресҳои гуногуни ҳамкории гуногун дар байни Sation1 ва OAS3 DI дар сохторҳои сафедаи худ дар Pymolo (Системаи графикии моликии Пимолик, версияи 2.0 Schrönge, LLC.);Stat1 (PDB ID: 1bf533 ва OAS3 (PDB ID: 4S3N34).Барнома.
Ду долформаҳои USP18 дар одамон, сафедаи дарозмуддат тавсиф шуда буданд, ки дар ядрезӣ, ва иштибоҳе, ки дар домени n-терминал ҷойгир аст, USP18-SPET, ки дар Cytoplasm ва ucleus 36 ҷойгир шудааст.Илова бар ин, N-Serverinus пешгӯӣ шуда буд, ки ба фаъолияти iSopeptidase, ё ISG1537 ҳатмӣ талаб намекунад.Аксарияти амалҳои ҳамкориҳои мо дар N-террористони сафеда муайян карда шудаанд ва ишора мекунанд, ки ин байнишавандагони USPP-ро дар бар мегирад:Ғайр аз он, маълумотҳои мо инчунин нишон медиҳанд, ки N-Serverinus барои ҳамкориҳои сафеда-то сафеда тахассус аст.Сайти ҳатмии IFNAR2 дар байни боқимондаҳо 312-368 ҷойгир аст ва алахусус, ҳеҷ кадоме аз сафедаҳо дар маҷмаа ба ин минтақа баста нашудааст (Расми 4а) 37,38.Ин маълумотҳо якҷоя шудаанд, ки домени ҳатмии IFNAR2 танҳо аз ҷониби протеетҳои ретсептор истифода мешавад.Илова бар ин, танҳо OAS3 ва Робо1 бо доменҳо аз болообҳои тости N-Serverinus ва сайти ҳатмии IFNARAT (расми 4а) алоқаманд буданд.
Робо1 ба эммоглобулин (IG) аз ҳадяи суолҳои гузаришҳои гузаришҳои гузаришҳои гузаранда (IG) тааллуқ дорад ва аз соҳаҳои IG ва доменҳои фиброн (фибат) дар минтақаи беруназсарӣ иборат аст.Ин доменҳои экстрассултавунорӣ аз ҷониби як минтақаи прокросон ва як бор дар минтақаи дохили дохили дохили дохили дохили дохили он ҷойгиранд ва пайдарпайии истиқомати истиқоматро дар бар мегирад, ки протсессинги мубодила протокринг inding39.Минтақа аз кислотаи аминокислотаҳо тӯл мекашад ~ 1100 то 1600 бештар бетартибӣ аст.Мо ёфтем, ки MX1 бо Робо1 тавассути IG, FN ва доменҳои дохили ва C-террористи Робо рух медиҳад (расми 4а, д).Аз ҷониби дигар, байнбарафаҳо бо DI, DIII ва OAS3 дар тамоми протопини Робо1 паҳн карда шуданд (Расми 4а).
Синттсаси Олигева (OAS) оилаи дудила (DSCRNA) RANACTIONS қабул ва банд мекунад (DSCRNA), аз дигаргуниҳои мутобиқат, ва синтез мекунад.Муайян карда шуд, ки дар байни семом, энд Синск дар сатҳи баландтарин барои DSRNA ва ҳадди аққал 2-5-ро синтез мекунад, ки метавонад RNASE L -ро маҳдуд кунад, ки метавонад такрори такрории вирусӣ 41-ро маҳдуд кунад.Оилаи OAS аз полимерзезезезезезезезец Бетта (Pol-β) -Анксияи nucletideide мебошад.Тадқиқоти қаблӣ нишон дод, ки фаъолияти каталити домейни C-и терминал (DIII) аз домени ҳатмӣ (DI) вобастагӣ дорад, ки барои фаъолсозии OAS342 зарур аст.Мо мушоҳида кардем, ки доменҳои OAS ва DII дар байни CCD ва минтақаи хурди хурд дар байни SH2 ва Stat 1 Tad ҳамкорӣ мекунанд (Расми 4а, F).Зиёда аз сайтҳои гуногуни Croslengining дар сохтори сафеда байни ҳалқаи β-Варақа ва DBD ва ҷайби кушод ва ҷайби кушод, ки бо боқимондаҳои 60-75 дар домени OAS3 ташаккул ёфтааст (расми 4G).Таъмини сафедаҳо дар маҷмаа инчунин қайд кард, ки ҳеҷ кадоме аз амалҳои байниҳамдигарӣ бо НАС3 халал намерасонад, ки ба қобилияти ДНК-и домени DI халал расонида нашудааст (Расми S1A).Ғайр аз он, домени N-терминали GTPATE MX1 incactions бо бунёди доменҳои DI ва DIII DIM3 (расми 4а).Мо инчунин ҳамкории байни OAS1 ва MX1-ро мушоҳида кардем, ки домени ягонаи OAS1 (инчунин Каталия фаъол) бо ҳар се доменҳои MX1 (расми S21, B) муошират кардем (расми S21, б).
Прототаҳои MX қисми як оилаи калони Denne-thanges доранд, ки доменҳои N-терминал доранд ).Доменчини домени домейн25,43.MX1 Binds ба зергураҳои полимерҳои вирусӣ барои бастани транскрипи геналуси вирусӣ.Экрани қабл аз хамиртуруши тоқатшуда нишон дод, ки PIS1-и алоқамандии MX1 бо роҳи бастани фаъолияти DNN-ҳо MEST1-ро боздошт кардааст ва инчунин дорои SMO ​​E3444,45 фаъолияти ligase.Дар ин ҷо, мо нишон медиҳем, ки mx1 bints ба Stat 1. (Расми 4C, D) Чӣ гуна ин ҳамкорӣ ба фаъолсозии генофтан дар посух ба IFNα таъсир мерасонад.Ғайр аз ин, мо инчунин ёфтем, ки MX1 бо IFIT3 ва DDX60 бо ҳар се такрори табобатшаванда ҳамкорӣ карда мешавад (Расми S2C).
DDEX60 чархи ситоплазани ситоплази ktoplasmic аст, ки қаблан гузориш дода шуда буд, дар таназзули Риг---и мустақилонаи вирусии Рауси вирусӣ бозӣ кардан аст.Он бо Rig-I ва сигналҳои худро дар шакли LIG-ҳо амал мекунад 46. DDX60 аз домени чархи DEXD / HODER-ҳо иборат аст, ки домени чархи терминали Раал ва ДНК47 аст.Аксари робитаҳои байниҳамдигарии он бо MX1 ва IFIT3 дар дохили минтақаҳои дарозмудаи N- ва C-C-ро бидуни доменҳои ширин ё мототикӣ рух медиҳанд (Расми S2E, F).Бо вуҷуди ин, MX1 инчунин бо домейни чархезаи DexD / HONT алоқаманд аст (Расми S2E).Сафедҳои оилаи IFIT TUNDEM Нусхаҳои фарқкунандаи Helix-Ref-Helix Notif-ро такрор карданд (TPR).IFIT3 модули мусбати оқибати Rig-ман ҷузъи комплекси Мавсро нишон дода, ба назар мерасид.Якҷоя карда шуд, маълумоти мо нишон медиҳанд, ки IFICT3 ва DDX60 асосан дар минтақа байни TPR байни TPR 3-6 аз IFIT3 ҳамкорӣ мекунанд ва метавонад дар Rig-I / Maves нақши зиёд дошта бошад (Расми S2F).
Бо назардошти он, ки тамоми протехнимро таҳқир мекунад, мо тамоми пойгоҳи додаҳои Undipt-и одамонро барои ҳузури яке аз такрори шахсии Indows санҷида мешавем.Дар ин ҷавобҳо мо барои HLA-№ шабакаи баландсифати байниҳамдигариро чандин маротиба эътимоднок ёфтем.Таҳлили роҳҳои сафеда, ки аз ҷониби MS / MS муайян карда шудааст, нишон дод, ки коркарди антигении MHC-II-ро дар асоси MHC-и манбунӣ ва муаррифӣ роҳи асосии интерферон (расми 3D) мебошад.Аз ин рӯ, мо ба омӯзиши ҳамкориҳои сафедаи MHC-I Malecules бо дараҷаи баланди эътимод ба ҳама намунаҳои пайвастшуда нигаронида шуда буд.HLA аз α1, α2 ва α3 доменҳо ва занҷирҳои рӯшноӣ иборат аст, ва миклоглобин β2 (β2m) протеини доимоамалкунанда.Пас аз он, ки дар барқароркунии эндеплазм ҷамъбаст шуд, HLA дар сурати набудани пепситҳо лигандеш аст.Чуқури peptient-inting-inding-inding-inding аз ҷониби полиморфӣ ва сохторҳои сохташуда ва α2 доменҳо дар шакли ғайримуқаррарӣ ва нисбат ба домени нисбатан сабуктар ва камтар аз он камтар ташаккул меёбанд.Дар ҳузури IFTETS, мо ду HLA-ро муайян кардем: яке бо HMGA1 ва H2B робита дорад (Расми 5, Ҷадвали S3, LRCH4 ва H2B (тасвири 6).
IFNT-ҳо як шабакаи байниҳамдигариро бо H2B (H2bfs) ва HMGA1 истифода мекунад.(A) 2D қитъаи 2D (дар нармафзори SIM-XL) тасвир мекунад, ки намудҳои гуногуни амалҳои гуногуни H2B-A-HMGA1 -ро тасвир мекунад: interlink (кабуд) ва истиноди ягона (сиёҳ)..Доменҳои шахсияти гуногун рамзгузории гуногун32: H2B (H15) ва MHC-I (MHC_1; 25-203, гурӯҳи C1; 210-290 ва MHC_I_364). 337-364.Ҳадди истинод дар 3.5 муқаррар карда шуд.Қитъаҳои DOT хля-як сайтҳои ҳамкорӣ бо H2B (B) ва HMGA1 (C) ва инчунин ҷойҳои муштараки K ё сония байни ду пепулҳо нишон медиҳанд.Дар расм, ҳадди аққали ҳисоби салиб ба 3.0 муқаррар карда шудааст.(Г) Муносибатҳо дар байни сафедаҳо дар сохторҳои H2B, HLA-A ва HMGA1 дар барномаи Пимол нишон дода шудаанд.
IFNT-ҳо як шабакаи байниҳамдигариро бо H2B (H2bfs), MDN1 ва LRCH4 ба назар мегирад.(A) CroslineLink (RELLOLELILESTILICILICILICILICINCAILIST (кабуд) ва (кабуд) дар харитаи интерактивии 2D пешниҳодшуда (дар нармафзори SIM-XL) бо MDN1 ҳамчун давра дода шудааст.Ҳадди истинод дар 3.5 муқаррар карда шуд.Доменҳои шахсиятҳои гуногун рамзҳои рангин мебошанд32: H2B LRR_8 (137-194) ва CH (535-641)).Б) муносибатҳои байни сафедаҳо дар сохторҳои H2B, HLA-A, LIRC4 ва сафедаҳои MDN1 дар барномаи Пимол нишон дода шудаанд.Ин сохторҳо бо истифода аз сервери Phyre2 моддаҳои (http://www.sbg.ic) бо сохторҳои қолаби 1К.ac.ac.ach549, 1TLU62 ва сафедаҳои MDN1 ва MDN1 ва MDN1 ва MDN1 ва MDN1 мутаносибан.Қитъаҳои DOT нишон медиҳанд, ки сайтҳои ҳамкории K ё STINESS барои HLA-A бо H2B (в), LRC4 (D) ва MDN1 (д) ва MDN1 (д).Барои қитъаҳо ҳадди ақали холҳои салиб ба 3.0 муқаррар карда шуд.
Илова бар нигоҳ доштани беайбии геноф, инчунин дар танзими транскрипт низ иштирок карда мешавад.Протеини H2B аз домени марказии (HFD) аз ҷониби се α-Харфе, ки ҳалқа ва думи сунъӣ 41,52 ҷудо карда шудааст, ташаккул ёфтааст.Аксарияти ҳамкорӣ бо H2B дар α1 helix аст, ки барои hfd бо hfd, ба HFD мусоидат мекунад (расми 5а, б).Гарчанде ки lysines дар ҳатмии DNS иштирок карда истодаанд, баъзе лигининҳо алтернатива ё сайтҳои метилативӣ мебошанд.Масалан, пасандозҳои K43, K46 ва K57 аз H2B ба ҳатмии мустақими ДНК ҷалб карда намешаванд, аммо ҳадафи тағйироти гуногуни интиқол53 аст.Ба ин монанд, пасмондаҳои K44, K47 ва K47 дар H2B метавонанд нақши алтернативӣ дар ҳузури IFNTET, аз ҷумла муошират бо дигар сафедаҳо нақши аввалиндараҷа кунанд (расми 5а, б).Ғайр аз он, гистонияи экстемахшо дар намудҳои гуногуни ҳуҷайра аксуламалро фаъол мекунад, то сенсозҳои споголикӣ барои ошкор кардани ДНК-и дукарата (DSDNA) аз агентҳои сирояткунанда ё ҳуҷайраҳои зарароваранд.Дар ҳузури вирусҳои ДНК, љойгиронии H2B ҷилавгирӣ кард Inn-β54 фосила фосидизатсия.H2B инчунин маълум аст, ки нисбат ба дигар хоҷагии дигар тезтар ва аз ядро ​​тезтар ҳаракат мекунад.Дар намунаҳои интихобшудаи MDN1 ва LRCH4 ҳамкории интихобшуда мушоҳида карда шуданд.Мо ёфтем, ки HLA-A бо h2b бо H2B дар ҳар се намунаҳои табобат ва ё яке аз намунаҳои такрории ғайрифаъол.Ин маълумот нақши H2B-ро дар функсияи алтернативии физиологӣ мустақил аз танзими транскриптӣ инъикос мекунад.
HMGA1 (Гурӯҳи баланди ҳаракат дарОн думи кӯҳии C-ро дорад ва се dbds муайяншуда дар қалмоқҳо номида мешавад, зеро онҳо ба чуқури ноболиғ аз минтақаи ночизе дар минтақаи сарватманд дар DSDNA55,56 мебароянд.Ин ҳатмӣ боиси дНКД ва рост мегардад, ки омилҳои транзии кримерикиро барои дастрасӣ ба пайдарпаии консенсуси худ имкон медиҳад.Гумон меравад, ки думи C-Terrinal дар ҳамкориҳои сафеда ва сафеда ва ҷалби омилҳои транзрика, зеро мутантҳои орпиналии C-Terrinal наметавонанд транскриппернипедрунтураи Транскрипскрипҳоро оғоз кунанд.Гузашта аз ин, ин домен дорои якчанд сайтҳои фосидксияи фосилизатсия мебошад, ки субстресҳои шинохта 58-ро шинохтаанд.Мо дар бораи HLA-A ва H2B дар берун аз домени C-A ва H2B мушоҳида кардем, ки домени C-ро асосан барои транскрипка истифода мекунад (Расми 5а, C).Протинҳои HMGA бо H1-ро бо истифода аз адаптер ДНК рақобат мекунанд, бо ин ба ин васила зудтар манъ аст57.Ба ин монанд, эҳтимол дорад, ки HMGA бо H2B H2B дар баробари пайвандгари H1 H1 амал мекунад.HMGB1 ифодаи HLA-A,-I-ро дар ҳуҷайраҳои dendritic, ки ба фаъолсозии онҳо фаъол аст, ки ба фаъолсозии онҳо, ки ба кор андохта мешаванд59, аммо ҳамкории байни HMG ва HLA қаблан гузориш дода нашудааст.Мо фаҳмидем, ки HMGA1 бо α1 ва α3 доменҳои HLA-α3 амал мекунад, бо аксари муштаракҳои хориҷӣ (ҷадвали 5а, в).Дар дасти мо, HLA-A дар ядрус маҳаллӣ ёфт шуд (нишон дода нашудааст), ва бо назардошти он H2B ва HMGA1 низ дар ядро ​​мавҷуд аст, ин ҳамкориҳо дар ядрус рух медиҳад.Теъдоди мушаххасе, ки байни H2B, HLA-A ва HMGA1 дар расми 5D нишон дода шудаанд.
Аксари амалҳои байниҳамдигарии HLA-AДар яке аз ин мисолҳо мо фаҳмидем, ки HLA-a мубодила бо думи вайроншудаи N-Terrinal N-Section (расми 6a, D).LRCH4 Factionation Sticking ва индекси ветинии CACKINE-ро танзим мекунадИн як протеини мембрана бо нӯҳҳои нӯгӣ (LRRS) ва оромии гоместори гомрикоӣ дар Ибодияи худ ва домени гузаранда (TMD) 60, 62 аст.Дар гузоришҳо доменҳои Ch, ки дар 60-уми протеин протеин протеин бо ҳамсарӣ миёнаравӣ карда шудаанд.Андозаи тақрибан 300 кислотаҳои аминокислотаҳо байни доменҳои LRR ва CH ба даст оварда мешаванд, аммо бетартибӣ мебошанд.Дар асоси вазифаи минтақаҳои бемасъулият ҳамчун миёнаравони шабакаҳои сафеда ва ҳамлу нақли аҳолӣ 63, мо дидем, ки аксарияти протетери протеин дар минтақаҳои фазо рух додаанд.Ҳамкорӣ бо MDN1 дар тӯли дарозии сафеда, аз ҷумла LRR1, LRR1, LRR1, LRR1, LRR1, LRR1, LRR1, LRR1, CHRENS, дар ҳоле ки H2B асосан ба домени C нигоҳ дошта шуд (расми 6а, б).Арортанятан, ба ҳеҷ як муошират "Ҳеҷ кадоме аз масъалаҳои таблиғотии TMJ, пешниҳод накардани махсуси равиши километри (расми 6a, б).
MDN1 инчунин ҳамчун як қисми шабакаи сафеда (расми 6а) муайян карда шудааст.Он ба оилаи AAA сафедаҳо (бандҳои марбут ба фаъолияти гуногун) тааллуқ дорад.Ин ҳамон домейни n -a терминал аст, ки ба як ҳалқаи edkameric ё аз 60 то 64 сюпартитҳои edunosomal ишора мекунад.Чунин ба назар мерасад, ки ба Далнин64,65,66 монанд аст.Илова бар ин, минтақаи сарватманди ҶТ / GLU аз ҷониби Мидо саҳифаи Мидас (макони вобастагии металлӣ) риоя карда мешавад.Аз сабаби андозаи калони MDN1 (тақрибан 5600 аминокислотаҳо) ва гомологияи маҳдуди он бо сафедаҳои хуб омӯхташуда, каме дар бораи сохтори он маълум аст ва дар одамон хеле маълум аст.Мо HLA-A, H2B ва LRC4 -ро ҳамчун шарики ҳатмии MDN1 муайян кардем ва самти онҳоро ҳамчун маҷмӯаи сафеда дар Панҷин (расми 6а, б) ошкор кардем.Ин се протета бо домени ААА, домени алоқаманди штамин монанд ва эҳтимолан Midas Domen.Дар гузориши қаблӣ, тозакунии дарпорти сафедаҳои доғи протеинҳои дати MDN1 ҳамчун протеин бо таърихи H2B67 алоқаманданд.Ғайр аз он, таҳқиқоти охирин инчунин гузориш доданд, ки бо истифода аз спектрҳои массажи шабеҳ ва бозёфтҳои мо.Муайян намудани ин мураккаб дар намунаҳои муосири IFNT-ТАҲСИЛОТ НИГОҲ ДОШТ ДАР БОРАИ МИДҲО НИГОҲ ДОШТ ДАР БОРАИ ИНТИХОМИ ИНТИХОМ
Азбаски аскҳои HLA Polymorphic мебошанд, мо запитатсия карда мешавад, ки мо тағир додани харитасозии HLA-A, -c-ро, ва -c аз RNAcence ROGDIOND-и чашмакҳои FLO-1 (маълумот номбар карда намешавем).Афзалиятҳои пепситкунандаро, ки бо хондани пайдарпай мувофиқанд, фарқияти назаррасро байни HLA-A (A) дар минтақаҳо нишон дод, ки пепсидҳои пайвастшуда дар HLA-A (Расми S3) ҷойгир шудаанд.Ғайр аз он, мо протеини пайвасткунии салиб-то-B / B / C Modecules бо H2B / HMGA1 / MDN1 / LRCH4 / LRCH4-ро риоя накардем.Ин нишон медиҳад, ки ҳамкориҳои сафеда байни HLA-A, MDN1, LRCH1 ва HMGA1 HLA-A хос пайдо шудааст.Ғайр аз он, таҳлили протеомикии намунаҳои ғайримуқаррарӣ (Ҷадвали S4) нишон дод, ки HLA-A Зиёда аз пӯшонидани пайдарпайи бештар дар муқоиса бо HLA-B ё HLA-C.Пептине, ки барои HLA-A муайян карда шудаанд, дар ҳарду намунаҳои табобати вақт ва вайроншуда хеле баланд буданд.
Боварӣ ҳосил кунед, ки ҳамкориҳои мутақобилаи мазкур дар ин ҷо вобаста ба пайвасти салиб номувофиқ буданд, дар наздикии фазоӣ ду протета буда, мо ду омилҳои навро аз ҷониби Delayscipity Con-Ammuncipity тасдиқ кардем.HLA-AМо тасдиқ кардем, ки HLA-A H2B-и аз ҷониби H2B-ро дар он замоне, ки HLA-A CHATEST табобат гирифтааст, зеро хадамот аз ҳуҷайраҳои имтиёзи беҷавоб (расми 7а) буд.Аммо, маълумотҳои мо нишон медиҳанд, ки IFSNα ба таври гуногун хларо ба танзим медароранд.IFNT Infort Ассотсиатсия байни H2B ва HLA-A, аммо Ассотсиатсияи онро бо MDN1 кам мекунад.Мо ёфтем, ки MDN1 бо HLA-A дар идоракунӣ алоқаманд буд ва илова намудани IFNTS ин робита бо индустраҳои MDN1-ро аз ҷониби IFTET-и MDN1 коҳиш дода шуд (Расми 7б, C).Илова бар ин, HLA-як Improfecipitiencience H2B-ро дар атхаю locections иваз кард (расми S4), ишора мекунад, ки ин ҳамкорӣ мустақил аз навъи ҳуҷайра мебошад.Якҷоя карда шуд, ин натиҷаҳо фаъолияти байниҳамдигарии байниидоракунандагони HLA-A бо H2B ва MDN1 дастгирӣ мешаванд.
HLA-A CURIFES H2B ва MDN1.Намояндаи H2B (A) ва MDN1 (A) ва MDN1 (B) Embuncolls аз ҳуҷайраҳои FLO-1-и табобатии FLO (B) ҳуҷайраҳои табобатии FLO-1 ва барои анибодиёнҳои зикршуда эмотримпиталиматсия карда шуданд.Муш ва харгӯш Игор ҳамчун назорати манфӣ истифода мешуд.(В) миқдори нисбии антитҳои гуногуни антивенсҳои мухталиф тасвир карда мешаванд, ки импурусҳо аз антиҷода нишон дода шудаанд, β-Атертин ҳамчун назорати боркунӣ истифода мешуд.
Хусусиятҳои сохтории яке аз шабакаҳои ғайритабиӣ-боэътимоди пайвасти зиччи шадид, H2B-HLA-A-HMGA1, таҳқиқ карда шуданд.Мо як усули молекулатиро ҳамчун муносибати алтернативӣ барои фаҳмидани динамикаи мутобиқии сафедаҳои дар ин маҷмаа, ки дар ин маҷмаа иштирок мекунад (Расми 8) истифода мебарем (Расми 8).Натиҷаҳои маълумот аз маълумоти кВтҳо имкони мутобиқати гурӯҳҳои гуногуни H2B, HLA-A ва HMGA1-ро пешниҳод мекунанд.Аз ин рӯ, маҷмӯаҳои эҳтимолӣ дар муҳити ҳалли онҳо модел карда шуданд: H2B-HLA-A, HMGA1-HLA-A ва H2B-HLA-A-A-A-HMGA1.Экрани ибтидоии протеин бо истифода аз MOE (муҳити молекулярӣ) бо истифода аз MOE (Moadeculation Pefive Inc., Moneale Commone, Квебек, Канада, ки мутобиқатҳои имконпазири байни ин сафедаҳо фарқ мекунанд (расми 8а).Ҷамъоварии маҷмӯи доғи ҷойгиркунии протеин якчанд ҳамкорӣ ва мутобиқатҳои имконпазирро ошкор кард (Тасвири 5а, 8).Ҳамин тариқ, як мутобиқати имконпазир дар расми 8а нишон дода шудааст (бо пайвандҳои нишоннамо) ва он аз истифодаи қубурҳои MD баҳо дода шуд.Илова бар ин, ҳатмӣ аз H2B ё HMGA1 ба HLA-A
Динамвери мутобиқати шабакаҳои имконпазир байни H2B (H2bfs) -hla (H2bfs) -hla (H2bfs) -hla-a, HMGA1-HLA-A ва H2B-HLA-A-H2BA1.(A) Гурӯҳи чап харитаи 2-ро (дар нармафзори SIM-XL) дар SIM-XL) -и Actamolular (RELLOLELLILELILECILECINCICT (RELLELLING (BlueLink Crountlink (Butofflink Fromofflink Tourcoft Roodlink)Илова бар ин, пасмондаҳои пайвастшавӣ муайяншуда дар сохторҳои H2B, HLA-A ва HMGA1.Мутобиқати алоқаманди ин сафедаҳо бо истифода аз лӯлаи лӯлаи лоғар дар бастаи ВМ.Панели поёнии чап мутобиқатҳои гуногуни имконпазири H2B-A ва HMGA1-HLA-ро бо мухолифи муқобили ҷангалҳои гуногун (GBVI / WSA DG; KCAL / MOL) нишон медиҳад.(Б) Додани стандартӣ (rms) мавқеи атом (ба истиснои объектҳои гидрогенӣ) барои ҳар як сохтори сафеда.(В) ҳамкориҳои мобайнӣ протогенӣ протоген-протехники сафедаи сафеда аз маҷмӯаҳои гуногуни шабеҳ, ки бо назардошти ҳамкориҳои мушаххаси мутақобилаи давомнокии давомнокии ≥ 10 Ц.Масофаи Ди-вомбарг ба 3.5 å accept å å "-ро ташкил дод ва кунҷи delor-H-orcordor donff ба ≥ 160 ° -180 ° муқаррар карда шуд.(Г) пасандозҳои нишондодашуда бо шарикони дахлдори худ, Spany бо шарикони худ, Spannoing ≥ 20 Ц-h2b ва хм-хм-h2b ва HMA-A-H2A-ро ташкил медиҳанд.Сохтори сафеда сохтори миёнаи 100 NS-ро ташкил медиҳад.Д) комплексҳои байни HLA-A-H2B ва H2A-A-H2B муқоиса карда шуданд, ки аз ҷониби H2B-HLA Simulation Simulations Simulations Simends Information Simulation Simulation Simulation Simulations дар асоси котибии K ё S дар асоси сайти Котси мотамин дар байни ду пепулҳо.Маҷмӯаҳо / HMGA1-HLA-A / H2B-HLA-A-HMGA1.Арзиши ҳадди ниҳоӣ барои арзёбии пайвастшавӣ ба 3.0 гузошта шудааст ва ҳамкориҳои мушаххаси MDS бо ≥ 10 NS ба ҳисоб гирифта шуданд.Бо истифода аз byovery Studial (SyStabia Cassasty, Systies, Biovia Corp., CATERINCESS INS., Group Commenteal Inc., Квебек, Канада, Канада).
Устувории HLA-як молекулаҳо бо гузашти вақт (тамоюлоти стандартӣ; rmsd ё dember1. RMSF қайд кард, ки прототҳои H2B ё HMGA1 дар маҷмӯаҳо HLA-A (Расми 8b, S5).Протеини HMGA1 ба сайти B2M-A B2M-in, ки устувории устувори HLA-A-HMGA1 ё H2B-A-H2B-A-H2B (расми 8B, SAVEAN-S5) баста мешавад.Аз ҷумла, пасандозҳои HLA ~ 60-90 ва ~ 180-200 дар ҳузури H2B камтар тағйирпазиранд (расми 8б).H2B ва HMGA1 ба HLA-A-A A-A-HMGA1 дар муқоиса бо H2B-A-HMGA1 нишон дода шудааст.Пас аз он, ки дар маҷмӯъи гидрогенӣ (MD ҷойгиршуда) ҷалб карда мешаванд, бо сайтҳои ҳамкории кВтизатсия (K ё пасмаҳои моделии) дар маҷмӯъ, пешниҳод мекунанд, ки ягонҷонибаҳои муайянкардаи кВтҳо хеле боэътимоданд.Эътимоднокӣ (расми 8E).Дар килосҳо ва моделсозии MD, HLA-A. Боқишаҳо дар байни солҳои 190-210 ва тақрибан 200-21,000 кислотаи кислотаи кислотаи кислотаи мо кислотаи мо кислотаҳо мебошанд, мутаносибан H2B ва HMGA1-ро банд мекарданд (расми 8E).
Ҷанбаҳои сафеда-протеин-протеин шабакаҳои динамикии сохторӣ, ки дар посух ба stimuli муайяни мубодила мекунанд, ташкил медиҳанд.Зеро бисёре аз бархӯрдҳои протопомикаҳо дар сатҳи умумии давлатии протеин, протексияҳои байнисоҳавии сафеда барои гирифтани интерфейси ҳатмии протезӣ, ва CLMS яке аз чунин асбобҳо талаб карда мешавад.Системаи сигнали интерферон як шабакаи ktokine мебошад, ки ба ҳуҷайраҳо имкон медиҳад, ки як қатор сигналҳои экологӣ ва оҳанин ва оҳанинро вокуниш нишон диҳанд, ҳомила дар индукӯби прототиҳои интерферон-мӯҳлатнок.Мо CLMS-ро истифода бурдем, то муайян намуда бошад, ки оё ҳамкориҳои сафеда-протеини протеин метавонанд дар байни панели сафедаҳои байниҳамдигарӣ муайян карда шаванд.Таҳлили истинодҳои пайвасткунандаи калони протексия дар модели ҳуҷайраҳои флот-1 ҷавобгар барои ба даст овардани маҷмӯаҳои сафеда истифода мешуд.Истихроҷи пепулҳои санҷишӣ аз чашмакҳои ғайриқонунӣ ва пайвастшуда барои ҳисобкунии пептуди, ғанигардонии прокер ва тақсимоти дарозии пахта бо шиддатнокии LFQ.Ҳамроҳкуниҳои байниҳамдигарии канникӣ - ҳамчун назорати доимии конверсикатсионӣ, дар ҳоле ки протагинҳои нави байниҳамдигарии байниҳамдигарӣ ва ҳамҷинобии байниҳамдигарии интерферон-муқаддимавӣ ба монанди MX1, UP18, OAS3 ва Статик ба қайд гирифта шудаанд.Хусусиятҳои гуногуни сохторӣ ва ҳамкорӣ дар минтақаҳои функсионалӣ тафтиш карда шуданд.
Ҳамкорӣ байни HLA-A, MDN1 ва H2b бо Emuntoblothting дар flo-1 ва A549 ҳуҷайраҳои A549 муайян карда шуда, бо IFTα-и AMPESTONS табобат ва табобатшаванда муайян карда шуд.Натиҷаҳои мо нишон медиҳанд, ки HLA-QUES бо H2B ба таври махсус вобаста аст.Кори мо хиёбони ҷолиб барои иктишофи минбаъдаи ҳамкории ин ду маҷмӯа мебошад.Татбиқи равиши киломплекси ба панели хатҳои ҳуҷайра, барои муайян кардани ҳамкориҳои байнитерферей-Муборизаи тиббӣ ва протехникии миёнамӯҳлат ҷолиб хоҳад буд.Ниҳоят, мо ба таври алтернативии MD-ро ҳамчун муносибати мутобиқати сафедаи H2BFS-HLA-A-HGA-A-HMGA1, ки ба гуфтугӯи таҳтистилекуликӣ ва мобайнӣ пайгирӣ кардааст, тарғиби коркарди MD-ро истифода мекардем.Натиҷаҳои маълумоти кВтҳо имкони мутобиқати тағйири гуногуни H2bfs, HLA-A ва HMGA1 -ро пешниҳод мекунанд.Мутобиқатҳои имконпазири гуногун байни ин маҷмӯаҳои сафедаи сафеда якчанд ҷуръатро ба онҳое, ки дар КМСИТАИ ПВС мушоҳида шудаанд, якчандсон буданд.Яке аз ҷиҳатҳои асосии усули мо дар он аст, ки он имкон медиҳад, ки омӯзиши истифодаи генлимонҳои ҳайратангез ба монанди HLA, аз ин рӯ, омӯзиши протезаҳои мушаххаси HLA halpotype, ки таҳсил кардан душвор аст, ҷолиб хоҳад буд.Якҷоя карда шуд, маълумоти мо нишон медиҳад, ки CLMS барои тавсеаи фаҳмиши мо дар шабакаҳои интерфергент-интерфертон истифода бурда мешавад ва барои омӯзиши системаҳои умумиҷаҳонии мураккаб дар микроевирони варам истифода бурда мешавад.
Ҳуҷайраҳои FLO-1 аз АТС ва дар DMAM (GIBCO) ба даст оварда шуданд ва дар DMACENTION / Streettomlin / Striptomenin / Striptomycin (Distetrogen), ки 10% хуни ҳомила аст ва дар 37 ° C ва 5% CO2 илова карда шудааст.Исоб.Ҳуҷайраҳои пеш аз табобат бо 150-80% (истеҳсол карда мешаванд), (истеҳсол карда мешавад), аз ҷониби иншооти Истеҳсоли Эдинбург.Ҳамаи дигар кимиёвӣ ва рецентҳо аз Сигма Александр харидорӣ карда шуданд, агар тартиби дигаре қайд нашуда бошад.
Чашмакҳои FLO Place 6-тонна ва рӯзи дигар фарҳангӣ буданд ва рӯзи дигар ҳуҷайраҳо бо 10 NG / ML IFF14 барои 24 соат то тақрибан 80% тасҳеҳ карда шуданд.Ҳуҷайраҳо се маротиба бо DSS BOS шуста шуданд ва бо DSS нав омода карда шуданд (дар DMSO FRESTER (дар DMSO FROTE) дар PBS барои 5-уми 5 ° C. Ба консентратсияи ниҳоии 0,5 мм.Реаксияи кроссҳои DSS бо PBS ва DSS боқимонда бо илова кардани 20 мм Трис (PHA 8.0) дар 15 дақиқа дар 37 ° C хомӯш карда шуд.Ҳуҷайраҳо бо харошидан ва ҷамъоварӣ карда шуданд, ки дар найҳои ками ҳатмӣ (Аксаргена) ҷамъ оварда шуданд.
Пеллети ҳуҷайра бо 300 мкл буферӣ (элементҳои 8 м) як були микрордори 800 (эраи мо, 0,1 м трис, 30 дақиқа дар ҳарорати вақт бо суръат.Ҳама қадамҳои сментфантатсия дар 14,000 XG дар 8 ° C иҷро карда шуданд.Сентрифутро 10 дақиқа ва супернатро ба қубури нав интиқол диҳед.Диаграммаи дуввумин буфери лизишти боқимонда гудохта шуд (2% Maea, Moade, 2% (W / V) SUDS (сулкифаи натрий Содекси натрий) барои ҳалли устувории якхела ба даст оварда шудааст.Lyyate барои 20 дақиқа тақсим карда шуд ва Supernatant бо lyyate бо lyyate ба қадами қаблӣ гирифта шудааст.Консентратсияи протеин бо истифода аз dessay bca Bca Bca Bca Bcay арзёбӣ карда шуд, то дастуроти истеҳсолкунанда барои расмиёти хурдкунанда.Намунаҳо зуд дар нитрогенҳои моеъ ях карда шуда буданд ва дар соати 2 -8 ° C нигоҳ дошта шуданд.
Тақрибан 100 мкг Протеини алоқамандии ҳалшаванда бо истифода аз протоколи тағйирёфтаи намунавии намунавии намунавии намунавии намунавии намунавӣ (маъриф) тавре ки Weathniewski ExectionSki et et.69 Хулоса, протеин бо 200 мкл буфери бегона (8 метрро дар 0,1 м дар 0,1 м тайка, ф).Ҳама қадамҳои спектатсия дар 14,000 XG дар 25 ° C иҷро карда шуданд.Нимаи аввали lysate pressin пайвастшуда ба дастгоҳи Филтри 10.000 XDRIFAGAN AT 10 KDA интиқол дода шуд, ки бо ultracel-10 мембрана (Merrok) муҷаҳҳаз карда шуд ва пас аз он, ки дар филтр барои 25 дақиқа муҷаҳҳаз карда шудааст.Сипас ними дуюми сафедаҳоро ба филтр илова кунед ва ҳамон қадамҳоро такрор кунед.Барқарорсозии протеин бо илова кардани 100 мм Трис (2-карбокситейстил) ин фосфорд (tcep) дар буфери бегона иҷро карда шуд.Барқароршавӣ ба термомиксер дар 600 RPM барои 30 дақиқа дар 37 ° C омехта карда шуд.Илова бар ин, сутун стандартфаст ва протеини камвазнро бо истифода аз 100 мкл дар буфери бебаҳо ба ҳам баробар буд.Муносибати алкила дар ҳарорати хонагӣ барои 20 дақиқа дар торикӣ гузаронида шуд.Сутунро иваз кунед, деворҳои сутунро 3 маротиба бо 100 мкл Буфери митой ва сипас сентрифуге шуед.Ҳамон амалиёт 3 маротиба бо истифода аз 100 мкл аз 100 мм аммоний аммоний.Пеш аз трипсинизатсия, субҳро бо як нав иваз кунед.Буфери ҳозимае, ки дорои 50 мм аммонатататро дар бар мегирифт ва 1 мкл Трипсин дар Трипсин Буфер (Promega) илова кунед.Таносуби Трипсин ба протеин тақрибан соати 1:33 нигоҳ дошта шуд ва ҳасадҳо шабона дар 37 ° C. Дар 37 ° C.Қитъаи крептлинишуда аз филтр бо Sentrifuguity барои 25 дақиқа ҳисоб карда шуд.Барқарорсозии шартиҳо бо илова кардани 50 микл 0,5 м NACL ба филтр, пас аз 25 дақиқа такмил дода шуд.
C18 Нишонаҳои SPARTS (Дастгоҳи ҳарфиш) ба пепокосҳои ороишӣ, ки пас аз протоколҳои Chrocal Case Eductienced пас аз протоколи Буфарӣ ва AL.70 бо тағиротҳои ночиз истифода шудаанд.Хулоса, сутунҳои SO18 СНИБО, C18 CHERTED бо се шуста 0,1% кислотаи форсӣ (FA) дар Acetonitrile (ACN) ва ду шуста 0,1%-.Дар сутун бо 0,1% FA барои 15 дақиқа гидриза бо 0,1%.Намунаҳои сарборӣ ба сутунҳои чарх ва 3 маротиба бо 0.1% FAC.Пепазидҳои думҳо бо назардошти мураккабии синну сол бо истифодаи 50%, 80% ва 100% ACN дар 0,1% FAC.Намунаҳо дар як консентратсияи Sparc Splus Plus (EppleNC) хушк карда шуданд. То он даме ки моеъи боқимонда нопадид шуд.Пепидҳои тасаллӣ дар 100 μL аз 1,08% кислотаи Trifluoraoroousticated дар 2,5% ACN ва консентратсияҳо дар Nanodrop 2000 (термо илм) чен карда шуданд.Тақрибан 1 мкг пептингиди прокрҳои Cromentninked ба системаи LC-MS / MS ворид карда шудааст.
Потисидолҳои пайвандак дар системаи ниҳоии 3000 RSLCNANO UNITERS (термо илм илми илмӣ) ба хомашти orduitrap пайваст шудаанд 480 spertroom Malk-ро (илмии термо) пайваст карданд.Потсидҳои пайвастшуда дар 300 μ μ μ μ-ПЕШГИРИИ СУХАТҲОИ К18 дар сутуни C18, ки бо C18 қабл аз C18 PEP-PEPMAP100 ҶОБИФАИ ПЕШГИРИИ ПЕШГИРИИ ПЕШГИРИИ ПЕШГИРИИ ПЕШГИРИИ ПЕШГИРИИ ПЕШГИРИИ ПЕШГИРИИ ПЕШГУФТАД.Маҷмӯи насосро дар 5 мкл / min / min 0.08% кислотаи трифлузооцетитикии дар 2,5% ACN гудохта мешавад.Потоколҳои пайвастшуда дар сутуни часпонидашуда бо диаметри ботинӣ бо диаметри ботинӣ аз 75 мм ҷудо карда шуда буданд ва дарозии 150 мм, ки бо 2 мм pepmap sorbent (термо илм) пур карда шудаанд.Марҳилаи мобилӣ A ва B аз 0.1% fa дар об ва 0,1% fa дар esetonitrile, мутаносибан иборат аст.Грелкрониро ба 2,5% бум аз 2,5% б ва хаттӣ то 40% б дар тӯли 90 дақиқа зиёд мекунад, пас то 90% B дар давоми 2 дақиқаи оянда.Объекти мобилӣ дар 90% б барои 10 дақиқа нигоҳ дошта шуд ва сипас дар тӯли 2 дақиқа ба таври хаттӣ коҳиш ёфт.Сутун дар 2,5% б барои 8 дақиқа пеш аз сикли навбатӣ баробар карда шуд.Потоколҳои салибмардашуда аз сутуни таҳлилӣ таҳти оғози манбаъи таҳлилӣ (NSI) -и Наноэлектро (NSI) ва ворид шудан ва ворид кардани омма 480 спектри оммавӣ (илмии илмӣ).
Exploris in orectoris 480 спектри оммавӣ дар ҳолати озодии маълумотҳои мусбат анҷом дод.Сканери пурра дар ҳолати қитъаи дар қарори қисм дар ҳалли 120,000 бо танзимоти диапазон аз м / Z то M / Z 2000, ки дар ҳалли 120,000 бо танзимоти ди.Ҳадафи мӯътадили агрегат бо миқдори зиёди вурудоти 50мҳо муқаррар карда шуд.Муайянкунии қуллаи Monoisotopic барои пепситҳо таъсис дода шудааст.Параметри кӯтоҳмуддат ба ҳузур гузошта шудааст, ки агар якчанд прекурсаҳо пайдо шаванд.Ҳадди ақал қудрати тасвибшудаи Иёлоти Муттаҳида ба 5.0e2ESTORTATE COUNTORSADER гузошта шудааст, ки +8 ба таҷрибаҳо дохил карда шудаанд.
Вақти давра байни сканҳои асосӣ дар ҳолати дастӣ 2,5 сония муқаррар карда шуд.Пас аз тақсимоти аввалини аввал Ҷоп кардани оммавии динамикӣ ба 20 сония муқаррар карда шуд.Тирезаи изолятори экстрезтар ба 2 баробар гузошта шуд.Навъи энергияи барҷаста бо режими бархӯрд бо муқаррароти собитшуда дар маълумоте, ки вобастагии MS / MS вобастагӣ гузошта шудааст.Энергияи бархӯрд ба 30%.ҚАЛИ ОНҲО ба 15,000 ва ҳадафи AGC то 100% муқаррар карда шуд.Вақти ҳадди аксар вақт ба 60 милискунонӣ муқаррар карда мешавад.
Пеш аз пайгирӣ кардани шабакаи сафеда ва протеини пайваста, мо файлҳои хомро бо истифода аз бастаи MAXQUES (версияи 1.6.12.0) 26,27 барои муайян кардани пепозҳои пайгирӣ дар намунаҳо таҳия кардем.Илова бар ин, таҳлилҳои шабеҳи протеометрӣ дар намунаҳои Undercoslinked Plo-1 бо ҳам табобат гирифта шуданд ва бо он вобастаанд.Маълумоти MS / MS дар пойгоҳи додаҳо (www.unpot.org) ҷустуҷӯ карда шуданд (www.unpot.org) (20 август) (205 август), ки 75,093 сабтро дар бар мегирад) бо истифодаи системаи ҷустуҷӯии сохташуда andromeda27.Ҷустуҷӯро бидуни нишон додани мушаххасоти фермент ва тағироти гуногуни пасандоз (N, Q) ва оксидатсия гузаронида шуд.Таҳаммулпазирии оммавии пешопаймоҳо дар 20 PPM ва EYS Маҳсулот дар 0,02 da муқаррар карда шуд.Даври баланд ва ҳадди аксар оммавии оммавӣ ба 10 PPM муқаррар карда шуд.Миқдори максималии пепид дар 4600 DA ҷойгир карда шуд ва пайдарҳад монандӣ дар байни 7 ва 25 аминокислотаҳо (aa) монанд буданд.Таҳлили минбаъдаи оморӣ бо истифода аз барномаи форсӣ анҷом дода шуд (версияи 1.6.10.45).Мундариҷаи протеин бо мақсади ба итмом расонидани шиддатнокии спектии шадид (шиддатнокии LFQ) ҳисоб карда шуд; миқдори ғайриқонунӣ;Клизерҳои иерархикӣ аз сафедаҳои худ, ки шиддатнокии пепситкунонии онҳо муайян карда шудаанд, бо истифода аз бастаи FHEETMAP (V1.0.12) сохта шудааст (V 4.1.2).Таҳлили ғанигардонии роҳи якбора барои сафедаҳои реактивӣ, ки зиёда аз чор маротиба дар муқоиса бо намунаҳои ғайримустақим фаъол буданд, иҷро карда шуд.
Муайян кардани лизайн (K) ё SERINE (S) ё SERINE (S) аз ҷониби LC / MS / MS-ро бо истифода аз мошини муайянкунандаи спектроскопӣ, ки тавассути мошини муайянкунандаи спектроскопӣ назорат карда шудааст (SIM-XL) барои пептезиҳои салиб (SIM-XL) амалӣ карда шудааст.Аввалан, ҳамкориҳои имконпазири марбут ба осебпазир (IFN) ба (IFD) ба осебдидашудаи мухолиф (IRDS) генҳо (IRDS) генҳо аз истифодаи IRDS Propeetet Prodariya et.28.Таҳлили ҳама шароит ва такрори тамоми Unternet инсонӣ шадид аст, аз ин рӯ тамоми пойгоҳи иттилоотии инсонӣ (www.unpot.org (www.unpot.org) (12 августи 20202).Яке аз филтрҳо барои ҳамкориҳои баланди эътимод.Ин ҳамкориҳои баландсифат ба даст оварданд ва дар ҳама такрорӣ ва шартҳо ба даст оварда шуданд.
Дар SIM-XL, DSS барои Cromplelinker (XL) ва гузариши XL Shift ва гузариши вазни тағирёбанда мутаносибан 138.06 ва 156.07 муқаррар карда шуд.Сомонаҳои реаксияи зерин баррасӣ карда мешаванд: kk, K, Ks ва Қуттиҳо, бе хабарнигор.PPM-и пешакӣ ва ҳамагурўз ба 20 ва Zreastred Xra муқаррар карда шуданд ва XREA ба 0,15 оварда шудааст.Трипсин комилан махсус ҳисобида мешуд ва усули аз ҳад зиёди C-джол (HCD) татбиқ карда шуд.Ҳадди XCRICITING DB коҳиш ёфтани меъёри ҳадди ақалли пептфаҳо барои коҳиш додани динамикӣ мутаносибан 2,5 ва 2 буд.Параметрҳои дигар инҳоянд: МонОисопопӣ ва болохона дар қуттиҳои ҳадди аққал 4 AA BATEATESS дар як ракена ва ҳадди аксар ситонида мешаванд ва 3 максималии лазизҳои беҷавоб.Дар натиҷа харитаҳои қаблан дӯхта дар натиҷаи он (SIM-XL) таҳлил карда шуданд ва барои сохтани харитаҳои 2D намояндаи графикии XQuert28 истифода мешуд.Producks Prodrinks оид ба сохторҳои сафеда дар Пимолин (системаи графикии Пимолик), нусхаи 2.0 Schrönger, LLC) дода мешавад.
Бо истифода аз сервери Phyre2, сохторҳои модели сафеда (http://www.sbg.ic.ic.ac.uk/phyre2 )11 Бо истифода аз принсипҳои моделсозӣ ва татбиқи "Усули пинҳоншудаи огоҳнамо" сохта шуданд.Phyre2 иншооти намунавии дар асоси ҳамоҳангсозии пайдарпай бо сохторҳои маъмулии протеини маълум.Барои H2bfs, H2BFS, H2BFS, H2BFS, H2BFS, H2BFS, H2BFS, HLA-A, HMGA1, LRGA1 ва MDNG4, ва MDN1, MDN1, Sorthations 1kX55, 1kj349, 2EZ55, 6hlu62 ва 6TI2665 истифода шуданд.Илова бар ин, сохтори алифбои Алифафолд71 MX1, UBP18 ва Робо1 низ баррасӣ шуд.Сохтори сафеда бо истифода аз Бюлутии Visualizer Visualizer Visualizer Visavial (Dassabrèmes, Biovia, SAN DIEGO, CATERACTIONTERS (MOSTERS INC., Монреец, Квебек, Канада).